Kõhulahtisust võivad põhjustada:

viirus- ja bakternakkused

ravimite kõrvaltoimed

soolehaigused (ärritatud soole sündroom, põletikulised soolehaigused, tsöliaakia)

hormonaalsed või ainevahetushaigused (nt kilpnäärme ületalitlus, diabeet) jt.